Μετά την απόφαση της UEFA για κατάργηση του Elite Round στην προκριματική φάση του Ευρωπαϊκού Πρωταθλήματος U17, διαφοροποιείται και ο αρχικός σχεδιασμός της ως προς τη διαδικασία πρόκρισης των ομάδων που θα έρθουν στην Κύπρο για την τελική φάση. 

Η προκριματική φάση αντί μεταξύ Οκτωβρίου - Νοεμβρίου 2020 θα διεξαχθεί τον Μάρτιο του 2021 με τη συμμετοχή 52 ομάδων σε 13 ομίλους. Από κάθε όμιλο θα προκριθεί μόνο η πρώτη ομάδα, σύνολο 13.

Ολλανδία και Ισπανία που είχαν τοποθετηθεί από την αρχή στον Elite Round λόγω της κατάταξης τους, θα συμπληρώσουν την δεκαπεντάδα των ομάδων που θα έρθουν στην Κύπρο τον Μάϊο του 2021.

Η Κύπρος ως διοργανώτρια χώρα, δεν θα λάβει μέρος σε προκριματική φάση. 

Αναλυτικά οι 13 όμιλοι της προκριματικής φάσης και σε παρένθεση η χώρα που θα φιλοξενήσει τους αγώνες:

1ος όμιλος: Βοσνία / Ερζεγοβίνη, Κροατία (γηπεδούχος), Βουλγαρία, Λιχτενστάιν
2ος όμιλος: Ιταλία, Σλοβενία, Ρουμανία (γηπεδούχος), Αλβανία
3ος όμιλος: ΕΪΡΕ (γηπεδούχος), Σλοβακία, Βόρειος Ιρλανδία, Εσθονία
4ος όμιλος: Βέλγιο, Ουκρανία, Γεωργία (γηπεδούχος), Λιθουανία
5ος όμιλος: Τουρκία (γηπεδούχος), Ρωσία, Νησιά Φαρόε, Γιβραλτάρ
6ος όμιλος: Πορτογαλία (γηπεδούχος), Τσεχία, Μαυροβούνιο, Κόσσοβο
7ος όμιλος: Σουηδία, Ισραήλ, Φινλανδία (γηπεδούχος), Καζακστάν
8ος όμιλος: Αγγλία, Ελλάδα (γηπεδούχος), Αζερμπαϊτζάν, Σαν Μαρίνο
9ος όμιλος: Αυστρία (γηπεδούχος), Νορβηγία, Ισλανδία, Μολδαβία
10ος όμιλος: Ουγγαρία, Ελβετία, Λευκορωσία, Λουξεμβούργο (γηπεδούχος)
11ος όμιλος: Γερμανία, Πολωνία, Βόρεια Μακεδονία (γηπεδούχος), Μάλτα
12ος όμιλος: Σερβία (γηπεδούχος), Δανία, Λετονία, Αρμενία
13ος όμιλος: Γαλλία, Σκωτία (γηπεδούχος), Ουαλία, Ανδόρρα