Το Πρωτάθλημα Γ’ Κατηγορίας την ποδοσφαιρική περίοδο 1999 – 2000 έγινε με τη συμμετοχή 14 ομάδων.
Τον τίτλο κατέκτησε η ομάδα του ΘΟΪ Λακατάμιας με απολογισμό 52 βαθμούς και εξασφάλισε άνοδο στη Β’ Κατηγορία μαζί με τον Ροτσίδη Μάμμαρι και τον Κινύρα Έμπας.
Διαβαθμίστηκαν Αχυρώνας Λιοπετρίου, Ελληνισμός Ακακίου και Δόξα Παλαιομετόχου.
Όπως φαίνεται και από το σχετικό δημοσίευμα, η άνοδος για ΘΟΪ και Ροτσίδη κρίθηκε πέντε αγωνιστικές πριν από το φινάλε.
Με απόφαση της Δικαστικής Επιτροπής ημερομηνίας 26 Απριλίου 2000, αφαιρέθηκαν έξι βαθμοί από τη Δόξα Παλαιομετόχου.
ΤΕΛΙΚΗ ΚΑΤΑΤΑΞΗ
| 1. | ΘΟΪ Λακατάμιας | 48-24 | 52 |
| 2. | Ροτσίδης Μάμμαρι | 47-26 | 48 |
| 3. | Κινύρας Έμπας | 50-29 | 47 |
| 4. | ΑΣΙΛ Λύσης | 45-29 | 46 |
| 5. | Ένωση Κοκκινοτριμιθιάς | 45-31 | 46 |
| 6. | ΣΕΚ Αγίου Αθανασίου | 46-39 | 39 |
| 7. | Αγία Νάπα | 42-48 | 37 |
| 8. | Οθέλλος Αθηαίνου | 48-42 | 36 |
| 9. | Εθνικός Λατσιών | 40-39 | 35 |
| 10. | Ακρίτας Χλώρακας | 50-50 | 33 |
| 11. | Άδωνις Ιδαλίου | 42-52 | 31 |
| 12. | Αχυρώνας Λιοπετρίου | 28-47 | 27 |
| 13. | Ελληνισμός Ακακίου | 30-54 | 20 |
| 14. | Δόξα Παλαιομετόχου | 26-77 | 6 |
